背景

笔者本科是计算机科学与技术,但是研究生研究方向与分子动力学模拟相关,特开此类贴子记录学习

安装软件下载

分子动力学常用软件为LAMMPS和GROMACS,笔者这里用GROMACS

 首先打开下面链接进行安装包下载,可选择自己适合的版本


 笔者这里用的是 2020.6 CUDA GPU加速版,AVX2指令集(88 MB) 版本,如下图一所示
图一

如果未安装Visual Studio,请下载安装如下插件



 GROMACS安装包下载完成后,将它解压到合适的路径,笔者的路径如图二所示
图二
 解压完成后,在搜索框输入环境变量,选中图三红框所示部分
图三
 打开环境变量,如下图四所示
图四
 打开Path,如下图五所示
图五
 新建一行,将之前GROMACS安装包解压的路径复制进Path里面,点击保存请注意,每个人解压的位置不同,路径位置也会不同,笔者这里的路径是D:\gromacs\gmx2020.6_GPU\bin,请读者复制自己的解压路径,如下图六所示
图六
 在搜索框输入CMD,打开如图七所示的命令提示符
图七
 在命令行输入gmx,如图八所示
图八
 出现如图九所示界面,恭喜你,安装成功
图九